(资料图)
1、blast的全称是基本局部比对搜索工具,是一种基于序列比对判断核酸或蛋白质的算法。
2、当你得到一个DNA序列(或者mRNA序列,蛋白质序列等。
3、),但是你不知道它属于哪个基因,有什么功能,你可以试着用blast从已知基因库中找出序列相同或最相似的基因。
4、blast有很多不同的子集,比如blastn输入核酸序列搜索核酸,blastp输入蛋白质序列搜索蛋白质。
5、blastx也是其中之一。
6、使用blastx。
7、你可以输入DNA序列,搜索蛋白质。
8、未知的DNA序列可能是正义链,也可能是反义链,读码框有3种可能,共6种可能。
9、blastx会帮你把这个序列的六种可能全部翻译成蛋白质,分别从库中查找,然后寻找最相似的返回结果。
本文到此结束,希望对大家有所帮助。